A Most Wanted Man berlangsung di masa sekarang Hamburg, Jerman yang misterius, disiksa dan hampir mati setengah Chechnya. Pria setengah-Rusia tiba di kota dengam mayoritas beragama Islam, membutuhkan bantuan dan mencari untuk memulihkan ayah Rusia-nya yang sakit sebelum terlambat mendapat keberuntungan.

Anak muda ini tampaknya menjadi korban, pencuri atau lebih buruk lagi, maksud ekstrimis pada kehancuran? Ditarik ke dalam jaring penuh intrik ini adalah seorang bankir Inggris pribadi dan pengacara perempuan muda bertekad untuk membela berdaya. Sementara itu, mereka sedang diawasi oleh kepala unit mata-mata rahasia Jerman yang brilian (Hoffman), yang berjuang untuk menempatkan potongan sebagai jam kutu (clock ticks).