"Nussa: The Movie" diawali dengan demi menyambut kehadiran sang ayah, yang sudah satu tahun tak pulang, Nussa mengikuti kompetisi ilmiah di sekolahnya. Saat sedang mempersiapkan proyek ilmiahnya, Nussa mendapat kabar bahwa ayahnya batal pulang. Di saat bersamaan muncul Jonni, siswa baru di sekolah yang seketika menjadi rival berat Nussa di kompetisi ilmiahnya. Nussa harus belajar tentang kesabaran dan arti dari rasa syukur.