"Kubo and the Two Strings" mengisahkan seorang bocah bernama Kubo (Art Parkinson) yang memiliki kehidupan tenang dan normal. Dia tinggal di sebuah desa kecil yang berada di pinggir laut. Kehidupan Kubo berubah dengan drastis ketika sesuatu hal memicu sebuah dendam lama. Saat ini terjadi banyak kekacauan antara dewa dan monster. Demi bertahan hidup Kubo harus mencari baju perang magis milik ayahnya yang seorang Samurai legendaris.