"The File" akan mengisahkan seorang pembawa acara berita bernama Soo Gyeong (Kang Byul) secara tiba-tiba bertemu kembali dengan teman masa kecilnya, Mi Soo (Ha Yeon Joo). Kembali di masa mereka remaja, Soo Gyeong memiliki kenangan yang menyakitkan kepada Mi Soo. Soo Gyeong pernah ditinggal sendirian pada sebuah lapangan baseball dan Mi Soo juga menghilang tanpa jejak. Saat mereka bertemu kembali Mi Soo telah berubah menjadi sangat berbeda.

Pada akhirnya mereka sering menghabiskan waktu bersama dan terkadang pacar Soo Gyeong, Dong Min (Lee Jong Hyuk), juga ikut bersama mereka berdua. Seiring perjalanan waktu sikap Mi Soo kepada Dong Min menjadi berbeda. Soo Gyeong mulai kawatir dengan keanehan dari Mi Soo kepada Dong Min.