Anjani (Shirley Anggraini) kabur dari rumah setelah ia dituduh bertindak asusila saat berpesta di villa ayahnya. Ia mengikuti Anggalih (Tim Matindas), cinta pertamanya dari SMP, yang sedang dalam perjalanan menjadi seorang pendeta Katolik. Dalam perjalanannya, ayah Anjani mengirim Ruben (Tio Pakusadewo), tangan kanannya, untuk membawa dan memaksa Anjani pulang.

Sementara Anggalih mengalami pergulatan batin dalam keputusannya menjadi seorang pendeta. Apakah Ruben berhasil membujuk Anjani pulang? Dan apakah Anjani juga berhasil merayu Anggalih? Toilet Blues adalah pertanyaan benar dan salah, surga dan neraka yang tidak selalu dimainkan untuk umum, seperti halnya grafiti serampangan yang ada di toilet umum yang dikunjungi Anjadi dalam perjalanannya dengan Anggalih.