"Universal Soldier: Day of Reckoning"bercerita tentang John (Scott Adkins) terbangun dari koma dan menemukan istri dan putrinya telah dibunuh dalam sebuah serangan. Dihantui oleh gambar dari penyerangnya, John bersumpah untuk membalas dendam kepada orang yang telah menghancurkan keluarganya.

Sementara di tempat lain, Luc Deveraux (Jean-Claude Van Damme) dan Andrew Scott (Dolph Lundgren) mempersiapkan diri untuk melawan teror dan membangun pasukan baru tanpa sepengetahuan pemerintah.

Saat John semakin dekat dengan Luc, Ia menemukan lebih banyak informasi tentang dirinya yang selama ini tidak diketahuinya.